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我正在尝试在 STAR 2.7.3a 上设置参考基因组,以便将 RNA-Seq 中的读数映射到它。

这是我使用的代码:

STAR --runThreadN 4--runMode genomeGenerate--genomeDir /media/bigData/Valentin/Software/referenceGenomeforSTAR--genomeDir /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome--genomeFastaFiles /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome/Homo_sapiens.GRCh38.ncrna.fa /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome/Homo_sapiens.GRCh38.dna.primary_assembly.fa--sjdbGTFfile /media/bigData/Valentin/ReferenceGenome--sjbdOverhang 100

由于致命输入而退出

错误:无法打开 readFilesIn=Read1

Jan 24 15:44:39 ...... 致命错误,退出

有谁知道 readFilesIn=Read1 是什么意思?

谢谢

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