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今天一直在学习如何使用 Drake，并设法迁移了我的代码，但还没有迁移我的 R markdown 报告。该报告编译得很好，并产生了预期的输出，但也给出了这个错误，没有多少搜索可以阐明。

来自德雷克的错误消息

我正在使用r_make()推荐的命令，到目前为止我的计划是：

plan_0 <- drake_plan(
  raw_c_data = read_rds(
    file_in("data/css_carib_data.rds")),
  raw_c_fg = read_rds(
    file_in("data/css_carib_fg.rds")),
  c_data = clean_caribbean_fg(raw_c_data, raw_c_fg),
  clean_c_fg = write_rds(
    c_data,
    file_out("data/clean_c_fg.rds"),
    compress = "gz"),
  c_maps = gen_maps(bbx_1, bbx_2, bbx_3, bbx_4, bbx_5),
  c_maps_out = write_rds(
    c_maps,
    file_out("data/c_maps.rds"),
    compress = "gz"),
  c_base_report = rmarkdown::render(
    knitr_in("R/0_prepare_data.Rmd"),
    output_file = file_out("0_prepare_data.html"),
    quiet = T)
)

该 Rmd 文件以以下内容开头

---
title: "0: Data Description"
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

require(drake)
require(tidyverse)
require(ggmap)

loadd(raw_c_fg)
loadd(clean_c_fg)
loadd(c_maps)
```

This document is a description of the data processed in `0_prepare_data.R` from the Caribbean region. The following table gives the counts of each classification within the aggregated functional groups.

```{r tables, echo = F}
raw_c_fg %>%
  pull(fg) %>%
  table() %>%
  knitr::kable(col.names = c("Class", "Count"),
               caption = "Counts of Each Functional Group")
```

我很乐意根据需要附加更多内容，但希望这足以了解为什么我会收到此错误？

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1 回答 1

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弄清楚出了什么问题，这是 Rmd 和 Rproj/drake 与相对位置之间的常见冲突。我在 R 目录中找到了 Rmd 文件，但 _drake.R 位于基本目录中，因此定位输出的差异导致 drake 查找错误的位置。

于 2019-12-08T06:59:26.220 回答