0

我尝试将 MuMin-Package 的疏通功能用于配备 glmmTMB 包的负二项式广义线性混合模型。

因为我的完整模型未能收敛,所以我尝试了此处描述的解决方法: Dredge with the global model failed to convergence

但是当我使用简化模型并重写model$call$function中的函数时,dredge会忽略此更改并使用简化模型而不是完整模型。

glmmTMB-package 的功能是否有另一种解决方法?

下面是一些示例代码:

# The full_model does not converge
full_model <- glmmTMB(y ~ x1 * x2 * (x3 + x4 + x5 + x6) + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2), data = df, family = "nbinom2")

# The simple_model does converge
simple_model <- glmmTMB(y ~ x1 + x2 + x3 + x4 + x5 + x6 + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2), data = df, family = "nbinom2")

# Change formula in the model
simple_model$call$formula <- y ~ x1 * x2 * (x3 + x4 + x5 + x6) + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2)

# use dredge, but this ignores the changed formula
dredge(simple_model)

谢谢!

4

1 回答 1

0

您将不得不替换simple_model $ modelInfo $ allForm. 这是三个公式:"formula""ziformula""dispformula",但在您的模型中,仅使用第一个公式。

于 2019-11-20T13:13:50.203 回答