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我有一系列看起来像这样的大型数据框：

Year   Variable   Class
1999   0.4504     a
1999   0.4244     a
1999   0.8980     b
1999   0.8901     b
2000   0.2552     a
2000   0.6504     a
2000   0.7830     b
2000   0.2030     b
...    ...        ...
...    ...        ...
2018   0.6520     a
2018   0.1403     a
2018   0.4502     b
2018   0.1240     b

有 15 个不同的班级，每年和班级至少有 500 次观察。我想做的是为每年和每个班级创建一个子集（所以 20 年 * 15 个班级 = 300 个子集），并制作一个 QQ 图来查看它们的分布，看看它们与正常情况有多大不同。

问题是，即使我可以使用循环创建子集，我也不知道如何存储这些图以便以后查看它们。

这个想法是这样的：

library(data.table)
library(ggpubr)

dataframe_list <- list.files(path="B:/Data/", pattern=".csv", full.names=TRUE)
years <- c(1999:2018)

for (i in 1:13){
  db <- fread(dataframe_list[i])
  for (j in 1:length(years)){
    db_year <- subset(db, db$Year==years[j])
    class <- levels(as.factor(db_year$Class))
    for (k in 1:length(class)){
      db_year_class <- subset(db_year, db_year$Class==class[k])
    } 
  }
}

使用以下方法在第三个循环中绘制图：

ggqqplot(db_year_class$Variable)

并以某种方式存储它，直到我把它们都放在循环的末尾。由于列表中的每个数据框至少有 300 个，因此将每个数据框的图存储在一个文件中会很棒。

编辑好的，这就是我改编它的方式：

library(data.table)
library(ggpubr)

dataframe_list <- list.files(path="B:/Data/", pattern=".csv", full.names=TRUE)
df <- c(A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M)
years <- c(1999:2018)
plot_list <- list()

for (i in 1:13){
  db <- fread(dataframe_list[i])
  for (j in 1:length(years)){
    db_year <- subset(db, db$Year==years[j])
    class <- levels(as.factor(db_year$Class))
    for (k in 1:length(class)){
      db_year_class <- subset(db_year, db_year$Class==class[k])
      plot_list[[k]] <- ggqqplot(db_year_class$Variable)+ggtitle(paste0("Code_0_", df[i], "_", years[j], "_", class[k]))
      outfiles <- paste0("B:/Results/Plot/Code_0_", df[i], "_", years[j], ".pdf")
      pdf(file=outfiles, onefile = TRUE)
      for(z in seq_along(list)) {
        print(plot_list[[z]])
      }
      dev.off()
    } 
  }
}

结果是每年的 pdf，这不是那么方便，但否则使用列表对象将不起作用：列表将在循环结束时被覆盖。

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这是一个供您使用的原型 - 我只是对数据集中cyl的值进行了一次循环mtcars，但您可以将其扩展到您的用例：

library(ggplot2)
#container list to hold ggplots
l <- list()

#unique cylinder groups
cyl_groups <- sort(unique(mtcars$cyl))

#iterate through each cylinder group, plotting mpg vs disp
for(j in seq_along(cyl_groups)){
  l[[j]] <- ggplot(mtcars[mtcars$cyl == cyl_groups[[j]], ], aes(mpg, disp)) + geom_point() + ggtitle(paste0("Cylinders = ", cyl_groups[j]))
}

#save into one PDF
pdf("plots.pdf", onefile = TRUE)
for(i in seq_along(l)) {
  print(l[[i]])
}
dev.off()

这为您在 PDF 上提供了每个绘图的页面。

于 2019-04-26T16:54:44.640 回答