5

尝试使用 BNlearn 创建 BN,但我不断收到错误消息;

Error in check.data(data, allowed.types = discrete.data.types) : variable Variable1 must have at least two levels.

它给了我每个变量的错误,即使它们都是因素并且有超过 1 个级别,如您所见 - 在这种情况下,我的变量“模型”有 4 个级别

由于我无法共享变量和数据集,因此我为数据集创建了一个小集合和所属代码。我遇到同样的问题。我知道我只共享了 2 个变量,但所有变量都出现相同的错误。

library(tidyverse)
library (bnlearn)
library(openxlsx)

DataFull <- read.xlsx("(.....)/test.xlsx", sheet = 1, startRow = 1, colNames = TRUE)
set.seed(600)
DataFull <- as_tibble(DataFull)

DataFull$Variable1 <- as.factor(DataFull$Variable1)
DataFull$TargetVar <- as.factor(DataFull$TargetVar)

DataFull <- na.omit(DataFull)
DataFull <- droplevels(DataFull)

DataFull <- DataFull[sample(nrow(DataFull)),]
Data <- DataFull[1:as.integer(nrow(DataFull)*0.70)-1,]
Datatest <- DataFull[as.integer(nrow(DataFull)*0.70):nrow(DataFull),]
nrow(Data)+nrow(Datatest)==nrow(DataFull)

FocusVar <- as.character("TargetVar")
BN.naive <- naive.bayes(Data, FocusVar) 

使用str(data),我可以看到该变量已经有 2 个或更多级别:

字符串(数据)

Classes ‘tbl_df’, ‘tbl’ and 'data.frame':   27586 obs. of  2 variables:
 $ Variable1: Factor w/ 3 levels "Small","Medium",..: 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 ...
 $ TargetVar: Factor w/ 2 levels "Yes","No": 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 ...

数据集链接:https ://drive.google.com/open?id=1VX2xkPdeHKdyYqEsD0FSm1BLu1UCtOj9eVIVfA_KJ3g

4

1 回答 1

8

bnlearn期望 a data.frame: 不适用于,因此通过省略该行将tibbles您的数据保留为 adata.frameDataFull <- as_tibble(DataFull)

例子

library(tibble)
library (bnlearn)

d <- as_tibble(learning.test)
hc(d)

check.data(x) 中的错误:变量 A 必须至少有两个级别。

特别是,它是从bnlearn:::check.data

if (nlevels(x[, col]) < 2) 
      stop("variable ", col, " must have at least two levels.")

在标准data.frame中,learning.test[,"A"]返回一个向量,因此nlevels(learning.test[,"A"])按预期工作,但是,根据设计,您不能从 : 中提取这样的向量tibblesd[,"A"])仍然是 atbl_df而不是向量,因此nlevels(d[,"A"])不能按预期工作,并返回零。

于 2019-03-01T09:51:39.350 回答