我有一组 3x3 旋转矩阵和一组对应的配体位姿平移向量。我一直在尝试实现一种 python 方法，在该方法中我将姿势转换为其原点，应用其中一个旋转矩阵，将姿势转换为其原始位置，然后应用平移向量。现在我一直在尝试实现 PyMOL API 命令：cmd.transform_selection()它需要一个选择和一个"ttt"PyMOL 矩阵（https://pymolwiki.org/index.php/Transform_selection）。
我目前的做法如下：
1.) 从原始姿势的 ( orig_pose)，我使用 ProDy 函数来获取坐标 ( org_coords)。
2.）我计算中心；center = np.mean(org_coords, axis=0)，其中中心是一个[x, y, z]矩阵。
3.) 然后我使用cmd.translate()withorig_pose作为选择，和 - center 作为平移向量。
4.）之后我想应用我的旋转矩阵并将其格式化为'ttt'矩阵（例如，[m0, m1, m2, 0, m4, m5, m6, 0, m8, m9, m10, 0, m12, m13, m14, 1]；参见：https ://pymolwiki.org/index.php/Transform_selection ）。然而，它似乎也对这个姿势应用了翻译。
有没有人有使用这个 API 命令的经验，或者遇到过一种方法让我在给定输入（一个 3x3 旋转矩阵和一个平移向量）的情况下转换一个对象？非常感谢您的帮助，谢谢！