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我试图弄清楚在特征选择之前删除高度相关和负相关的特征是否明智。这是我的代码的快照

def find_correlation(data, threshold=0.9, remove_negative=False):
        corr_mat = data.corr()
        if remove_negative:
            corr_mat = np.abs(corr_mat)
        corr_mat.loc[:, :] = np.tril(corr_mat, k=-1)
        already_in = set()
        result = []
        for col in corr_mat:
            perfect_corr = corr_mat[col][corr_mat[col] > threshold].index.tolist()
            if perfect_corr and col not in already_in:
                already_in.update(set(perfect_corr))
                perfect_corr.append(col)
                result.append(perfect_corr)
        select_nested = [f[1:] for f in result]
        select_flat = [i for j in select_nested for i in j]
        return select_flat

corrFeatList = find_correlation(x)
fpd = x.drop(corrFeatList,axis = 1 )

fpd['label'] = catlabel 
fpd = fpd[fpd['label'].notnull()]

Features = np.array(fpd.iloc[:,:-1])
Labels = np.array(fpd.iloc[:,-1])

hpd = fpd.iloc[:,:-1]
headerName = hpd.columns

#Scale first
#Scaling normalisation
scaler = preprocessing.StandardScaler()
Features = scaler.fit_transform(Features)

#RFECV logReg first
## Reshape the Label array
Labels = Labels.reshape(Labels.shape[0],)

## Set folds for nested cross validation
nr.seed(988)
feature_folds = ms.KFold(n_splits=10, shuffle = True)

## Define the model
logistic_mod = linear_model.LogisticRegression(C = 10, class_weight = "balanced") 

## Perform feature selection by CV with high variance features only
nr.seed(6677)
selector = fs.RFECV(estimator = logistic_mod, cv = feature_folds)
selector = selector.fit(Features, Labels)

Features = selector.transform(Features)
print('Best features :', headerName[selector.support_])

因此,我尝试了删除相关功能和不删除相关功能,并获得了完全不同的功能。RFECV 和其他特征选择(降维方法)是否考虑了这些高度相关的特征?我在这里做正确的事吗?最后,如果删除高阈值特征是一个好主意,我应该在这样做之前进行缩放。谢谢你。

凯文

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1 回答 1

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RFECV 只需获取您的原始数据,对模型进行交叉验证,并丢弃分类器/回归器提供的具有重要性的最不重要的特征。然后它递归地对所有retaied特征做同样的事情。所以它没有明确意识到线性相关性。

同时,特征的高相关性并不意味着其中之一是最好的删除候选者。高度相关的特征可以承载一些有用的数据信息,例如它可以比保留的特征具有更小的方差。

在一般情况下,降维并不意味着移除高度相关的特征,但是像 PCA 这样的一些线性模型会隐含地做到这一点。

于 2019-01-09T17:25:05.630 回答