0

我在 R 的 MuMin 包中运行一个线性混合效应模型的疏通，模型很大（见下文）

>     Monster <- lmer(Fw.FratioFall ~ Average_mintemp_winter + (Average_mintemp_winter^2)
>                     + percentage_woody_coverage + (percentage_woody_coverage^2)
>                     + kmRoads.km2 + (kmRoads.km2^2) + Fracking 
>                     + WELLS_ACTIVED + (WELLS_ACTIVED^2) + BadlandsCoyote.1000_mi
>                     + (BadlandsCoyote.1000_mi^2) + cougar_presence + COYOTE_springsurveys
>                     + (COYOTE_springsurveys^2) + d3.1 + (d3.1^2) + WT_DEER_springsurveys
>                     + (WT_DEER_springsurveys^2) + WT_DEER_fallsurveys + (WT_DEER_fallsurveys^2) 
>                     + ELK_springsurveys + (ELK_springsurveys^2) + ELK_fallsurveys + (ELK_fallsurveys^2)     
>                     + (BadlandsCoyote.1000_mi*WELLS_ACTIVED) + (BadlandsCoyote.1000_mi*d3.1) 
>                     + (BadlandsCoyote.1000_mi*WELLS_ACTIVED*d3.1) 
>                     + (cougar_presence*percentage_woody_coverage) 
>                     + (COYOTE_springsurveys*WELLS_ACTIVED) 
>                     + (percentage_woody_coverage*cougar_presence*COYOTE_springsurveys)
>                     + (Average_mintemp_winter*COYOTE_springsurveys) 
>                     + (Average_mintemp_winter*BadlandsCoyote.1000_mi)
>                     + year + (1 | YEAR) + (year | StudyArea),  REML = F, data = mydata)

Dredge 功能现在已经在 i7 处理器上运行了 15 个小时，我想知道这是否正常，对于这种尺寸的模型，我应该期望什么样的时间范围？

我检查了日志并且 R 没有崩溃，挖泥机仍在运行（它正在大量生产“奇异拟合”模型）

singular fit
singular fit
singular fit
singular fit
singular fit
singular fit

我测试了一个较小的模型，疏通功能大约需要一分钟

较小的型号

> sample <- lmer(Fw.FratioFall ~ Average_mintemp_winter +
> (Average_mintemp_winter^2)  + year + (1 | YEAR) + (year | StudyArea), 
> REML = F, data = mydata)

任何人都可以建议使用 MuMin 包的模型挖泥船的时间框架。谢谢你。

4

1 回答 1

0

正如一些评论者所说，疏通功能会根据要测试的模型数量增加其解决时间。建议选择那些您认为应该具有最佳解释能力的变量，您不应该“去钓鱼”模型，而是尝试生成最适合您的模型来测试。

我试过一个有 19 个变量的模型，估计解析时间是 79 分钟

于 2021-07-15T19:01:42.313 回答