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这个问题与这里提出的问题非常相似：Element-wise mean of several big.matrix objects in R。

但是，现在我的目标是计算 18 个文件支持的 big.matrix 对象（每个 > 4GB）的元素平均值，同时考虑到 na.rm = TRUE。

对于正常大小的矩阵，我会执行以下操作：

#Generate a list of 3 example matrices
my.list <- list(matrix(c(1:9), nrow = 3), 
                matrix(c(10:18), nrow = 3), 
                matrix(c(19:27), nrow = 3))
my.list[[1]][1,1] <- NA
my.list[[3]][2,1] <- NA

#Take element-wise mean with na.rm = TRUE 
test <- apply(simplify2array(my.list), 1:2, mean, na.rm= TRUE)

#This results in:
> test
      [,1] [,2] [,3]
 [1,] 14.5   13   16
 [2,]  6.5   14   17
 [3,] 12.0   15   18

我正在使用具有 16GB RAM 的 64x Windows10 机器。

任何建议都非常受欢迎。谢谢！

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