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我正在处理格式为 nii.gz 的图像。因此,我使用nibabel来打开它们。问题是,当我打开图像,将它们转换为 numpy 数组并将它们转换回 Nifti 格式时,输出大小会发生变化。顺序是:

nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')
np_img = ct_images.get_fdata()
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti
nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')

初始文件是~45 MB,运行上面的代码后,图像是~65 MB. 我知道原始图像是 16 位编码的。我最初的理论是,当转换为 numpy 数组时,它们被编码为64-bit确实如此。所以我尝试了以下方法:

nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')
np_img = ct_images.get_fdata()
np_img = np_img.astype(numpy.float16, copy=False)
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti
nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')

但是,输出仍然是相同的大小~65MB。任何想法为什么会发生这种情况?

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您应该将原始 nifti 仿射和标头信息添加到输出 nifti。例如,在您的情况下:

nifti_final = nib.Nifti1Image(data, nifti_image.affine, nifti_image.header)

于 2019-02-22T15:19:34.383 回答