我正在使用从 PDB 下载的 5IVW。这有 5 个亚基;每个都有自己的残基编号——如果我为残基 1-100 着色,则有 5 组残基被着色。如果我用鼠标选择原子,我会看到子单元的标识:例如 5IVW/B/... ;即我已经选择了亚基 B 中的原子。但是我如何通过其内部名称选择亚基或 pymol 中的任何内容——这样我就可以为亚基 B 中的残基着色?该文档包含有关按原子、元素、残基等进行选择的大量信息。
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我正在使用从 PDB 下载的 5IVW。这有 5 个亚基;每个都有自己的残基编号——如果我为残基 1-100 着色,则有 5 组残基被着色。如果我用鼠标选择原子,我会看到子单元的标识:例如 5IVW/B/... ;即我已经选择了亚基 B 中的原子。但是我如何通过其内部名称选择亚基或 pymol 中的任何内容——这样我就可以为亚基 B 中的残基着色?该文档包含有关按原子、元素、残基等进行选择的大量信息。
查看5IVW的高分子部分。这里,结构中的六个链(或亚基)被命名为V、W、0、1、2和3。因此,您进行名为“subunit2”的选择的语法应该是:
select subunit2, chain W
请注意,在 /5ivw/ B中,B 代表 segi-identifier 而不是链或子单元。