r - R脚本，data_path问题<-粘贴

Question

这是我在qiime 论坛上分享的R 脚本的顶部。该脚本旨在为多个 fastq 文件制作元数据文件。我如何编辑它以运行而不需要每次都编辑但我似乎无法告诉它使用当前的工作主管

这是问题代码：

#!/usr/bin/env Rscript
library(tidyverse)

data_path <- paste ("./", "Data", sep = "/")

及其错误：

Error in `[<-.data.frame`(`*tmp*`, "direction", value = "forward") : 
  replacement has 1 row, data has 0
Calls: [<- -> [<-.data.frame
Execution halted

Answer 1

要将工作目录设置为 Data 文件夹：

setwd("Data/")

Answer 2

谢谢@forestfanjoe 和@TingleTanglBob 的帮助对于想知道如何格式化setwd 的任何人，请参阅这个工作示例=）

data_path <- paste (setwd ("Data/"),"Data", sep = "/")