r - check.length("fill") 中的错误：'gpar' 元素 'fill' 的长度不得为 0

Question

我遇到了一个非常奇怪的错误，可能是一个错误R 3.5.1或pheatmap

以下代码工作正常：

rownames(df) <- colnames(mat)
xx <- pheatmap(mat, annotation_col=df)

但以下不起作用：

rownames(df) <- str_sub(colnames(mat), 1, -3)
xx <- pheatmap(mat, annotation_col=df)

一切看起来都很完美，但它给出了错误：

check.length("fill") 中的错误：'gpar' 元素 'fill' 的长度不得为 0

我重新加载Rstudio但问题仍然存在。的任何修改都会导致rownames无法df绘制图表。我也试过substr功能。有谁知道为什么会这样？

Answer 1

问题是colnames(mat)应该与 匹配rownames(df)，所以我不能只修改一个而没有另一个。以下代码有效：

colnames(mat) <- str_sub(colnames(mat), 1, -3)
rownames(df) <- colnames(mat)
xx <- pheatmap(mat, annotation_col=df)