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我mpirun在 OS X 上以单机模式使用时遇到问题。使用运行我的程序时，mpirun -np 5 my_program我得到以下错误输出：

[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/pls/base/pls_base_orted_cmds.c at line 275
[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/pls/rsh/pls_rsh_module.c at line 1158
[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/errmgr/hnp/errmgr_hnp.c at line 90
mpirun noticed that job rank 1 with PID 85940 on node ...-MacBook-Pro.local exited on signal 6 (Abort trap). 
2 additional processes aborted (not shown)

显然，默认情况下mpirun用于rsh连接到机器。我尝试ssh改用，但没有帮助：

mpirun --mca pls_rsh_agent ssh -np 5 my_program

然后，我尝试使用共享内存 ( sm) BTL，但也无济于事：

mpirun --mca btl self,sm -np 5 my_program

最后，我尝试使用机器文件来指定我只想使用localhost，这也没有帮助：

mpirun -np 5 -machinefile machinefile.local my_program

在这里，machinefile.local仅包含localhost（单个）第一行。

在上述所有情况下，我都会收到上述超时错误。

另外，我确认我的 Mac OS X 防火墙没有运行，我可以通过 ssh 进入我的机器。

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所以看起来你正在使用 fink 的 OpenMPI 版本，对吗？你在 /usr/bin 和 /usr/lib 中还有原来的 1.2.x MPI 吗？寻找奇怪的启动问题的第一个地方是 MPI 库的版本冲突。

首先尝试一些简单的东西，比如/usr/bin/mpirun -np 5 hostname，然后无论你的 fink mpirun 是什么地方，都做同样的事情：/path/to/fink/mpirun -np 5 hostname，只是为了确保两个 MPI 启动器在非 MPI 程序上工作。然后做一个lddon my_program; 它链接到哪些库？对这些库使用适当mpirun的，看看是否有效。

于 2011-03-03T13:53:40.613 回答
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检查您的防火墙并确保它允许 mpirun 建立入站和出站连接。

于 2011-03-04T15:31:27.357 回答