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我有我想要的XY数据（高维数据的 2D嵌入） 。数据被分配给几个s，所以我想对点进行颜色编码，然后为每个添加一个标签，它具有与 s 相同的颜色编码，并且位于（尽可能）之外的点。tSNEscatter plotclusterclusterclusterclustercluster

知道如何使用 and or 来做到R这ggplot2一点ggrepel吗plotly？

这是示例数据（XY坐标和cluster分配在 中df，标签在 中label.df）及其ggplot2一部分：

library(dplyr)
library(ggplot2)
set.seed(1)
df <- do.call(rbind,lapply(seq(1,20,4),function(i) data.frame(x=rnorm(50,mean=i,sd=1),y=rnorm(50,mean=i,sd=1),cluster=i)))
df$cluster <- factor(df$cluster)

label.df <- data.frame(cluster=levels(df$cluster),label=paste0("cluster: ",levels(df$cluster)))

ggplot(df,aes(x=x,y=y,color=cluster))+geom_point()+theme_minimal()+theme(legend.position="none")

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包中的geom_label_repel()功能ggrepel使您可以轻松地为绘图添加标签，同时尝试“排斥”标签不与其他元素重叠。对您现有代码的一点补充，我们在其中汇总数据/获取放置标签的坐标（这里我选择了每个集群的左上角区域 - 这是 x 的最小值和 y 的最大值）并合并它使用包含集群标签的现有数据。在调用中指定此数据框，并在 中geom_label_repel()指定包含label美学的变量aes()。

library(dplyr)
library(ggplot2)
library(ggrepel)

set.seed(1)
df <- do.call(rbind,lapply(seq(1,20,4),function(i) data.frame(x=rnorm(50,mean=i,sd=1),y=rnorm(50,mean=i,sd=1),cluster=i)))
df$cluster <- factor(df$cluster)

label.df <- data.frame(cluster=levels(df$cluster),label=paste0("cluster: ",levels(df$cluster)))
label.df_2 <- df %>% 
  group_by(cluster) %>% 
  summarize(x = min(x), y = max(y)) %>% 
  left_join(label.df)

ggplot(df,aes(x=x,y=y,color=cluster))+geom_point()+theme_minimal()+theme(legend.position="none") +
  ggrepel::geom_label_repel(data = label.df_2, aes(label = label))

输出

于 2018-07-01T06:18:04.507 回答