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我正在尝试按照设置说明开始Reticulate工作。RMarkdown但是,我无法在单独的 Python 单元或 Python 和 R 单元之间共享状态,因为文档表明我应该能够。这是我的设置和输出:

单元格 1(设置):

{r}
library(reticulate)
path_to_python <- "/Users/User/anaconda3/bin/python"
use_python(path_to_python)
knitr::knit_engines$set(python = reticulate::eng_python)
py_available(initialize = TRUE)

输出:

[1] TRUE

单元格 2(在 Python 中设置变量):

{python}
x = 2

单元格 3(尝试访问 R 中的 Python 变量):

{r}
py$x

输出:

Error in py_get_attr_impl(x, name, silent) : AttributeError: module '__main__' has no attribute 'x'

单元格 4(在 R 中设置变量):

{r}
x <- 2

单元格 5(尝试在 Python 中访问 R 变量):

{python}
r.x

输出:

Traceback (most recent call last):
  File "/var/folders/2b/dgy6vs4n3lbfy2xqwc3gqq9m0000gn/T/RtmpTqIR6P/chunk-code-108b44104ec28.txt", line 1, in <module> r.x NameError: name 'r' is not defined

单元 6(尝试在后续 Python 单元中访问先前的 Python 变量):

{python}
x

输出:

Traceback (most recent call last):
  File "/var/folders/2b/dgy6vs4n3lbfy2xqwc3gqq9m0000gn/T/RtmpTqIR6P/chunk-code-108b44520d158.txt", line 1, in <module> x NameError: name 'x' is not defined

任何帮助或建议将不胜感激!我已经尝试过指向reticulate不同的 Conda 环境和 Python 安装,但没有成功。谢谢!

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我想我已经想通了。我误解了网状文档,认为这意味着我可以在 RStudio 中以交互方式在 Python 单元之间共享状态。仔细阅读 Github 上的未解决问题后,似乎 RStudio 集成仍在进行中。当直接使用 knitr 来编织文档时,我得到了单元格之间共享状态的预期行为。

于 2018-03-22T17:57:42.437 回答
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这在当前的 RStudio 中已修复,例如1.2.1114。但是,如果您像我一样坚持使用 RStudio Server Pro 1.1.456,一种解决方法是reticulate::repl_python()通过将 python 块复制粘贴到 python 控制台来运行它们。如果您需要在两者之间运行 R 块,您可以再次关闭并打开控制台 - 将保持状态。当你完成黑客攻击后,你可以毫无问题地编织整个文件。

于 2019-02-05T19:29:14.440 回答