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这段非常简单的代码，

# imports...
from lifelines import CoxPHFitter
import pandas as pd

src_file = "Pred.csv"

df = pd.read_csv(src_file, header=0, delimiter=',')
df = df.drop(columns=['score'])

cph = CoxPHFitter()
cph.fit(df, duration_col='Length', event_col='Status', show_progress=True)

产生错误：

回溯（最后一次调用）：文件“C:/Users/.../predictor.py”，第 11 行，在 cph.fit(df, duration_col='Length', event_col='Status', show_progress=True)

文件“C:\Users\...\AppData\Local\conda\conda\envs\hrpred\lib\site-packages\lifelines\fitters\coxph_fitter.py”，第 298 行，适合 self._check_values(df)

文件“C:\Users\...\AppData\Local\conda\conda\envs\hrpred\lib\site-packages\lifelines\fitters\coxph_fitter.py”，第 323 行，在 _check_values cols = str(list(X .columns[low_var]))

文件“C:\Users\...\AppData\Local\conda\conda\envs\hrpred\lib\site-packages\pandas\core\indexes\base.py”，第 1754 行，在 _ _ getitem _ _

结果 = 获取项目（键）

IndexError：布尔索引与维度 0 上的索引数组不匹配；维度为 88，但对应的布尔维度为 76

但是，当我打印df本身时，一切都很好。如您所见，一切都在图书馆内。图书馆的例子工作得很好。

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1 回答 1

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在不知道您的数据是什么样子的情况下 - 我遇到了同样的错误，当我从我正在使用的 pandas df 中删除除持续时间、事件和系数之外的所有内容时，该错误得到了解决。也就是说，我在 df 中有很多额外的列让 cox PH fitter 感到困惑，因为您实际上并没有指定要包含哪个 coef 作为 cph.fit() 的参数。

于 2018-01-23T02:43:38.527 回答