python - 如何在pymol命令行中启用python循环？

Question

这里说脚本应该在 pymol 命令行中使用。我想在阅读后使用循环输出许多距离。但我收到错误消息：

File "<string>", line 1
    for i in range(resi_total_n):
                                ^
SyntaxError: unexpected EOF while parsing

我的代码是：

from pymol import cmd
mol_name='name'
resi=10 # the target residue number
resi_total_n=500 # the total residue number

f=open('dist.txt','w')
resi_n=0
for i in range(resi_total_n):
    resi_n += 1
    dst=cmd.distance('tmp',mol_name+'///'+str(resi)+'/ca',mol_name+'///'+str(resi_n)+'/ca') #the alpha carbon
    f.write("%8.3f\n"%dst)
f.close()

Answer 1

在这里我找到了答案：

在尝试进行编程时，最好坚持使用 Python。将以下内容另存为 script.py 并run script.py在 Pymol 中使用或仅发出pymol script.py

Answer 2

您不需要将脚本作为单独的文件运行。您可以将 for 循环全部放在一行上，例如，

当您运行此代码时：

for c in chains:
    print c

你得到这个错误：

File "toplevel", line 1
for c in chains:
               ^

SyntaxError: unexpected EOF while parsing

但如果你写：

for c in chains: print(c)

给出输出

A
B
C
D