python - allen-sdk get_flourescence_timeStamps

Question

我相信我正在正确下载 NWB 文件，因为我能够毫无问题地获得 df/F 轨迹和刺激信息。但是，当我尝试调用“get_running_speed”时收到错误消息：

AttributeError：“BrainObservatoryNwbDataSet”对象没有属性“get_flourescence_timeStamps”

当我调用“get_fourescence_timeStamps”函数时，我也会收到同样的错误。我已经更新了 allen sdk 包，所以我应该使用最新版本的软件。

这是其他人可以复制的问题吗？

Answer 1

您的问题中的拼写是否正确？ get_flourescence_timeStamps大写的“S”不是函数。两者都没有get_fourescence_timeStamps丢失l。

这是在内部调用该函数的地方get_running_speed：

https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/blob/master/allensdk/core/brain_observatory_nwb_data_set.py#L807

看起来拼写正确。这是 的定义get_fluorescence_timestamps：

https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/blob/master/allensdk/core/brain_observatory_nwb_data_set.py#L256

您能否发布一个重现您的错误的小代码片段？