我正试图用它multidplyr
来加速residuals
从regression
健康中恢复过来。我创建了一个function
适合regression
模型以获得 的residuals
,除了数据之外,它还获得了另外两个参数。
这是function
:
func <- function(df,reg.mdl,mdl.fmla)
{
if(reg.mdl == "linear"){
df$resid <- lm(formula = mdl.fmla, data = df)$residuals
} else if(reg.mdl == "poisson"){
df$resid <- residuals(object = glm(formula = mdl.fmla,data = df,family = "poisson"),type='pearson')
}
return(df)
}
这是我将尝试我的multidplyr
方法的示例数据:
set.seed(1)
ds <- data.frame(group=c(rep("a",100), rep("b",100),rep("c",100)),sex=rep(sample(c("F","M"),100,replace=T),3),y=rpois(300,10))
model.formula <- as.formula("y ~ sex")
regression.model <- "poisson"
这是multidplyr
方法:
ds %>% partition(group) %>% cluster_library("tidyverse") %>%
cluster_assign_value("func", func) %>%
do(results = func(df=.,reg.mdl=regression.model,mdl.fmla=model.formula)) %>% collect() %>% .$results %>% bind_rows()
但是,这会引发此错误:
Error in checkForRemoteErrors(lapply(cl, recvResult)) :
3 nodes produced errors; first error: object 'regression.model' not found
In addition: Warning message:
group_indices_.grouped_df ignores extra arguments
所以我想我将参数传递给func
from的方式do
是错误的。
知道什么是正确的方法吗?