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我知道这已经出现了很多,但我已经查看了所有其他答案,但没有一个与我相关。

我正在尝试从源代码编译神经成像软件 FSL(我必须这样做,我的 Linux 发行版不支持它)。我已按照此处列出的所有说明进行操作,并且已编译了大约 80%。然而,有一些模块没有成功,它们似乎都可以追溯到试图编译 CiftiLib-master 的问题。

根据说明,每当我尝试运行“make”命令时,它都会返回:

Makefile:34: warning: overriding recipe for target 'clean'
/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/config/common/rules.mk:32: warning: ignoring old recipe for target 'clean'
gcc -c -Wall -ansi -pedantic -Wno-long-long     -m64  -g -O3 -fexpensive-optimizations -m64  -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/boost -g -DCIFTILIB_USE_XMLPP -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/libxml2 -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/libxml++-2.6 -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/lib/libxml++-2.6/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/extras/include/boost -I./Common -I./Nifti -I./Cifti  -I. -I/include -I/home/thosvarley/Desktop/fslbuild/fsl/include  -o Common/XmlAdapter.o Common/XmlAdapter.cxx
In file included from Common/XmlAdapter.cxx:28:0:
Common/XmlAdapter.h:56:10: fatal error: libxml++/libxml++.h: No such file or directory
 #include "libxml++/libxml++.h"
          ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
compilation terminated.
make: *** [Makefile:19: Common/XmlAdapter.o] Error 1

因为我不是要编译一个 foo.c 文件,而是要编写一个程序,所以我看到的很多建议似乎并不适用于我。我已经安装了其他帖子(libxml2、libxslt1 等)中建议的所有各种 libxml 包。

我无法对错误消息做出正面或反面:我根本不熟悉编译 C 程序(这是我第一次认真尝试从源代码构建)。如果答案很明显而我只是不认识,请提前道歉。

我在 Antergos Linux(Arch 内核)上,我认为这可能是问题所在,因为所有其他在这之后提出问题的人似乎都在 Debian 或 Ubuntu 上。

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我一直在尝试解决同样的问题。貌似libxml++默认是捆绑FSL的,捆绑版本编译失败。

解决方案#1:安装和使用旧的编译器(例如 GCC 4.8),因为项目的配置是为了适应那些旧的编译器

我不能保证这个解决方案,因为我自己没有尝试过(因为显然,我喜欢让自己的生活变得困难),但这可能是你最好的选择。

解决方案#2:手动修复问题

注意:这不是一个全面的解决方案,但它可能会为您指明正确的方向。

您的第一个问题很可能是您默认使用的编译器使用的 C++ 标准比项目编写时使用的更新的 C++ 标准。这会导致输入流和输出流到布尔值的隐式转换失败。您可以通过在 makefile 配置中弄乱编译器标志来解决它,但是修复代码的有问题的部分可能更容易。相关行(FSL 5.0.11)是:

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/istreamparserinputbuffer.cc (line 42)
  return _input;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_input);

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/ostreamoutputbuffer.cc (line 32)
  return _output;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_output);

- extras/src/libxml++-2.34.0/libxml++/io/ostreamoutputbuffer.cc (line 39)
  return _output;
  SHOULD BE
  return static_cast<bool>(_output);

根据您尝试安装的版本,实际的行号可能会有所不同,但它们可能位于相同的一般区域中。

一个问题是在通用 makefile 配置INC_XML++中没有定义包含路径。这很可能是您的系统默认设置的,因为没有 GCC 版本 > 4.8 的配置。通过添加以下行来编辑文件(您添加它的确切位置并不重要):INC_XML++CONFINC_XML2config/generic/externallibs.mk

# XML++
LIB_XML++ = ${FSLEXTLIB}
INC_XML++ = ${FSLEXTINC}/libxml++-2.6
INC_XML++CONF = ${FSLEXTLIB}/libxml++-2.6/include
INC_XML2 = ${FSLEXTINC}/libxml2

(我添加了 LIB_XML++ 以获得良好的衡量标准,因为 lib 路径是由文件中的其他变量定义的,但我不是 100% 确定它是必要的。)

同样,这是在我的系统上修复它的原因。根据您下载的源代码的版本,您可能会有所不同,但至少这是一个起点。

修复这些错误后,CiftiLib-master 目标应该可以编译. 但是,如果您的系统与我的系统类似,那么这远不是构建过程中唯一的错误。查看该build.log文件并进行搜索error:应该可以让您很好地了解哪些项目会导致哪些错误,以及修复它们可能需要什么。这些问题在性质上可能与 CiftiLib 的问题相似。

最后提示:如果您的libgd项目无法编译,请查看error:消息。它可能会抱怨一些未声明的标识符(IMG_FMT_I420, PLANE_Y, PLANE_U, PLANE_V)。如果您在这些标识符前面加上VPX_,它应该可以工作。失败的原因是因为库的更新删除了已弃用标识符的定义,迫使用户使用较新的前缀标识符。

这是我所到之处。我假设一年后你还没有对此感到困扰,但我将把它留给后代。

于 2018-11-11T17:21:19.353 回答