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我正在使用 R 包 rnoaa(连同它需要的其他包)来收集历史天气数据。我编写了这个嵌套循环来收集所有数据集,但是当我运行它时我不断收到错误。它似乎运行了第二次罚款

循环:

require('triebeard')
require('bindr')
require('colorspace')
require('mime')
require('curl')
require('openssl')
require('R6')
require('urltools')
require('httpcode')
require('stringr')
require('assertthat')
require('bindrcpp')
require('glue')
require('magrittr')
require('pkgconfig')
require('rlang')
require('Rcpp')
require('BH')
require('plogr')
require('purrr')
require('stringi')
require('tidyselect')
require('digest')
require('gtable')
require('plyr')
require('reshape2')
require('lazyeval')
require('RColorBrewer')
require('dichromat')
require('munsell')
require('labeling')
require('viridisLite')
require('data.table')
require('rjson')
require('httr')
require('crul')
require('lubridate')
require('dplyr')
require('tidyr')
require('ggplot2')
require('scales')
require('XML')
require('xml2')
require('jsonlite')
require('rappdirs')
require('gridExtra')
require('tibble')
require('isdparser')
require('geonames')
require('hoardr')
require('rnoaa')
install.package('ncdf4')

install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("rnoaa", "ropensci")
library(rnoaa)


list <- buoys(dataset='wlevel')
lid <- data.frame(list$id)
foo <- for(range in 1990:2017){
for(bid in lid){
bid_range <- buoy(dataset = 'wlevel', buoyid = bid, year = range)
bid.year.data <- data.frame(bid.year$data)
write.csv(bid.year.data, file='cwind/bid_range.csv')
} 
}

响应:

Using c1990.nc
Using 
Error: length(url) == 1 is not TRUE

它保存了第一个数据集,但它没有在文件名中应用 for,它只是将其命名为 bid_range.csv。

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1 回答 1

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这个错误信息表明在 1990 年没有给定站 id 的任何数据。因为您使用的是 for 循环,一旦出现错误,它就会停止。

这里我介绍使用tidyverse下载 NOAA 浮标数据。以下许多功能来自purrr包,它是tidyverse.

# Load packages
library(tidyverse)
library(rnoaa)

第 1 步:创建一个包含 id 和 year 的所有组合的“Grid”

expand函数 from可以创建不同值的tidyr组合。

data_list <- buoys(dataset = 'wlevel')

data_list2 <- data_list %>%
  select(id) %>%
  expand(id, year = 1990:2017)

第 2 步:创建一个在没有数据时不会中断的“安全”版本。也使这个函数适用于 map2 函数

因为我们将使用它的和参数来循环使用函数的map2所有组合idyear使用。我们将参数序列修改为 create 。我们还使用该函数来创建. 现在,当它遇到错误时,它将存储错误消息并移动到下一个而不是中断。map2.x.ybuoy_modifysafelysafebuoy_modify

# Modify the buoy function
buoy_modify <- function(buoyid, year, dataset, ...){
  buoy(dataset, buoyid = buoyid, year = year, ...)
}

# Creare a safe version of buoy_modify
buoy_safe <- safely(buoy_modify)

第 3 步:应用 buoy_safe 函数

wlevel_data <- map2(data_list2$id, data_list2$year, buoy_safe, dataset = "wlevel")

# Assign name for the element in the list based on id and year
names(wlevel_data) <- paste(data_list2$id, data_list2$year, sep = "_")

完成此步骤后,所有数据都下载到wlevel_data. 中的每个元素wlevel_data都有两个部分。$result下载成功则显示数据,否则显示NULL. $error显示NULL下载是否成功,否则显示错误信息。

第 4 步:访问数据

transpose可以将列表“由内而外”。所以现在wlevel_data2有两个元素:结果和错误。我们可以存储这两个并访问数据。

# Turn the list "inside out"
wlevel_data2 <- transpose(wlevel_data)

# Get the error message
wlevel_error <- wlevel_data2$error

# Get he result
wlevel_result <-  wlevel_data2$result

# Remove NULL element in wlevel_result
wlevel_result2 <- wlevel_result[!map_lgl(wlevel_result, is.null)]
于 2017-09-15T07:38:58.697 回答