我已经Spyder3.2.1在我的 Debian v-9.1.0 64 位 Linux 平台上安装了当前版本的 Miniconda3。Spyder 表现良好，但我在安装 RDKit 时遇到了困难。
我按照以下说明进行操作RDKit_Docs_current.pdf：
如何
RDKit使用 Conda进行安装使用这些软件包创建一个新的 conda 环境
RDKit需要一个类似于以下的命令：
$ conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit最后，必须激活新环境，以便相应的 python 解释器在同一个 shell 中可用：
$ source activate my-rdkit-env
安装过程中没有警告或错误消息，但是当我尝试运行一个简单的 Python 脚本时：
#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Tue Aug 15 11:41:24 2017
@author: comp
"""
from __future__ import print_function
from rdkit import Chem
m = Chem.MolFromSmiles('Cc1ccccc1')
m
我得到：
IPython 6.1.0 -- An enhanced Interactive Python.
runfile('/home/comp/Apps/Python/untitled0.py',
wdir='/home/comp/Apps/Python')
Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-1-3842c59475d8>", line 1, in <module>
runfile('/home/comp/Apps/Python/untitled0.py',
wdir='/home/comp/Apps/Python')
File "/home/comp/Apps/miniconda3/lib/python3.6/site-
packages/spyder/utils/site/sitecustomize.py", line 688, in runfile
execfile(filename, namespace)
File "/home/comp/Apps/miniconda3/lib/python3.6/site-
packages/spyder/utils/site/sitecustomize.py", line 101, in execfile
exec(compile(f.read(), filename, 'exec'), namespace)
File "/home/comp/Apps/Python/untitled0.py", line 10, in <module>
from rdkit import Chem
ModuleNotFoundError: No module named 'rdkit'
RDKit 安装在~/miniconda3/envs/mr-rdkit-env
不幸的是，我不知道问题可能是什么，我们将不胜感激。
提前致谢。