workflow - Snakemake：在递归子工作流程场景中引用超出父级的输出

Question

我有一个包含三层子工作流的工作流，其中 wfA 是 wfB 的子工作流，是 wfC 的子工作流。

执行 wfC 时，如果需要，wfA 和 wfB​​ 都会正确执行。

在 wfC 中我可以执行 wfB("some/output")，但我不能执行 wfA("some/output")，因为它会给出“未定义名称 'wfA'”错误。

这是支持的东西吗？还有其他办法吗？

Answer 1

目前，这不受支持，我认为除了扁平化层次结构之外别无他法。