我正在处理多变量数据,试图将土壤细菌多样性(通过元条形码获得)与环境因素联系起来,看看哪些因素可以解释细菌多样性的最大变化。我正在使用 phyloseq 包进行大部分分析。我设法通过例如编写不同类型的协调
ps.rda <- ordinate(ps, formula = ps ~ ., method = "RDA")
但是,我想做一个 RDA,逐步选择重要的环境变量。(如包ordistep()
中的功能vegan
)。您知道在 phyloseq 包中对此进行编码的方法吗?任何意见是极大的赞赏。