我正在使用 ITK-SNAP 来比较几个条件之间几个感兴趣区域的强度。
对于某些主题,我需要使用“配准”工具将一张图像与另一张图像重新对齐。
但是,我注意到无论我如何注册,我在参考图像上绘制的特定分割的强度值都不会改变。
两个图像之间的值会有所不同,但即使我手动将第二个图像注册到完全关闭的东西,它也会保持不变。
是否可以根据它在注册图像上的位置来获得我的分割的实际平均强度?
我正在使用 ITK-SNAP 来比较几个条件之间几个感兴趣区域的强度。
对于某些主题,我需要使用“配准”工具将一张图像与另一张图像重新对齐。
但是,我注意到无论我如何注册,我在参考图像上绘制的特定分割的强度值都不会改变。
两个图像之间的值会有所不同,但即使我手动将第二个图像注册到完全关闭的东西,它也会保持不变。
是否可以根据它在注册图像上的位置来获得我的分割的实际平均强度?
细分菜单,选项“卷和统计...”应该会告诉你你在找什么。
注册不会影响强度。根据您转换图像的方式,它会影响体素的位置和协调!它与强度无关!它可以改造、重塑、旋转或平移图像。如果您期望注册后的不同强度,您需要应用一些其他技术而不是注册!因为所有的变换矩阵都应用于坐标和位置。您应该使用数据的其他功能!有一些配准方法会影响强度,但例如在 ITKSNAP 中没有使用它们。你应该寻找它的特殊包装。
例如这篇论文是关于:
通过最小化光照变化下加权减法的复杂性来进行基于强度的图像配准
这是专门玩融合的强度。 https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1746809415001755
另一个例子是这个基于强度的自动配准的 matlab 脚本,该过程从您指定的变换类型和内部确定的变换矩阵开始。它们一起确定了应用于具有双线性插值的运动图像的特定图像变换。
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1746809415001755