我有一组看起来像这样的数据:
rep stage line temp surv
1 L 149 18 0.6
2 L 149 18 0.7
3 L 149 18 0.25
1 A 149 18 1
2 A 149 18 1
3 A 149 18 1
1 L 149 25 0
2 L 149 25 0.2
3 L 149 25 0.3
1 A 149 25 1
2 A 149 25 1
3 A 149 25 1
1 L 208 18 0.6
2 L 208 18 0.4
3 L 208 18 0.55
1 A 208 18 1
2 A 208 18 1
3 A 208 18 1
1 L 208 25 0
2 L 208 25 0.05
3 L 208 25 0.05
1 A 208 25 1
2 A 208 25 0.857142857
3 A 208 25 0.7
rep 是重复的,stage 是我正在研究的果蝇的生命阶段(L = 幼虫,A = 成虫),line 是遗传系的编号,temp 是饲养温度,surv 是存活的比例。
我想要做的是,使用 R 中的 lme4 包,拟合 3 路交互模型(线性混合模型)来运行 ANOVA。我的原始模型:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*line*temp + (1|rep), data=dat_3w)
有效,但我想将线条视为随机效果。我认为我正确地将 rep 视为分组变量(1|rep)
,但我不确定。
我试过这个模型:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*temp*(1|line) + (1|rep), data=dat_3w)
但后来我的三向互动就消失了。
基本上,我在寻求帮助,在 line、stage 和 temp 之间建立一个三向交互模型,其中 line 是随机的,rep 是分组变量