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我正在使用 Python 中的 DEAP 包来编写一个程序,用于优化进化算法,特别是遗传算法。

我需要在 python 中使用列表类型来创建染色体。这条染色体应该有五个不同范围的浮动基因(等位基因)。

我的主要问题是创建这样的染色体。但是,如果我可以为此使用 deap 包的 tools.initRepeat 功能会更好。

对于所有基因都在同一范围内的情况,我们可以使用以下代码:

import random

from deap import base
from deap import creator
from deap import tools

creator.create("FitnessMax", base.Fitness, weights=(1.0,))
creator.create("Individual", list, fitness=creator.FitnessMax)

IND_SIZE=10

toolbox = base.Toolbox()
toolbox.register("attr_float", random.random)
toolbox.register("individual", tools.initRepeat, creator.Individual,
                 toolbox.attr_float, n=IND_SIZE)

我从这里得到的。

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我在这里找到了一个很好的推荐。

def genFunkyInd(icls, more_params):
    genome = list()
    param_1 = random.uniform(...)
    genome.append(param_1)
    param_2 = random.randint(...)
    genome.append(param_2)
    # etc...

    return icls(genome)

icls代表单个类)参数应该接收创建者创建的类型,而配置范围的所有其他参数可以像more_params参数一样传递,也可以在脚本中使用定义的常量。这是它在工具箱中的注册方式。

toolbox.register('individual', genFunkyInd, creator.Individual, more_params)

它手动为染色体创建一个类。我不知道这是否是最佳选择,但它可以用来解决我的问题。

于 2017-03-16T20:55:15.863 回答
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要创建在五个不同范围内具有五个浮动基因的个体,您可以执行以下操作

low = [1, 0, 0, -10, 3] #lower bound for each of the ranges
high = [1234, 1024, 1, 0, 42] #upper bound for each of the ranges

functions = []
for i in range(5):
    def fun(_idx=i):
        return random.uniform(low[_idx], high[_idx])
    functions.append(fun)

toolbox.register("individual", tools.initCycle, creator.Individual,
                 functions,
                 n=1)

toolbox.individual()
于 2019-11-06T09:39:39.863 回答