r - 在没有互联网访问权限的 AWS-VPC 上运行 R-Notebook

Question

我在没有互联网访问的 AWS-VPC 上运行 RStudio-server。当我尝试打开新的R-Notebook时，它卡在加载轮屏幕上。我有两个假设：

1. RStudio 尝试连接到互联网（出于某种原因）。既然不能，就卡住了；
2. 依赖问题。

其他一切正常（正常的 R 脚本）。

为 RStudio 提供服务的机器是带有 Ubuntu 16 的 EC2 实例，我通过同一 VPC 中的 Windows Server 2008 实例进行连接。

有什么替代假设吗？

Answer 1

两者都是。它可能缺少依赖项，因此它尝试连接到 Internet 以下载它们。等待发生是因为它在超时之前等待来自远程服务器的响应。

rmarkdown具有以下依赖项：

• 工具
• 实用程序
• 针织机 (≥ 1.14)
• yaml (≥ 2.1.5)
• htmltools (≥ 0.3.5)
• ca工具
• 评估（≥ 0.8）
• base64enc
• jsonlite
• rprojroot
• 方法

如果您等待它超时，它会告诉您缺少哪些包。

可以通过设置来减轻等待时间：

options(repos = NULL)

这将立即带来错误消息（并停止 URI 查找）

我没有尝试将存储库设置为指向本地 CRAN 存储库（使用 miniCRAN 制作），但最安全的方法是将其设置为NULL，然后通过手动安装丢失的存储库R CMD INSTALL <package.tar.gz>