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我正在尝试安装一个名为 metaBIT 的程序。我能够将它添加到我的 PATH 中。但是当我执行时:

metaBIT -h 

它出错并给了我这个:

Traceback (most recent call last):
File "/Users/twpierson/edirect/metaBIT", line 12, in <module>
import pysam
File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/pysam/__init__.py", line 5, in       <module>
from pysam.libchtslib import *
ImportError: dlopen(//anaconda/lib/python2.7/site-  packages/pysam/libchtslib.so, 2): Library not loaded: libcurl.4.dylib
 Referenced from: //anaconda/lib/python2.7/site-packages/pysam/libchtslib.so
 Reason: Incompatible library version: libchtslib.so requires version 9.0.0    or later, but libcurl.4.dylib provides version 7.0.0

我已经使用谷歌搜索尝试了关于这个错误的所有可用建议。

我试图卸载并重新安装 pysam。

pip uninstall pysamp 
pip install pysam

我仍然得到同样的错误。请帮忙!

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我建议安装MacPortsHomebrew版本cURL

$ sudo port install curl

这将使用 MacPorts 安装最新版本cURL(此时为 7.52.1)/opt/local/bin/curl。MacPorts 应该完成在 macOS/OS X 上使用这个最新版本的 cURL 所需的所有链接。安装后,您可以libcurl.4.dylib通过以下方式检查版本:

$ cd /opt/local/lib
$ otool -L libcurl.4.dylib
libcurl.4.dylib:
    /opt/local/lib/libcurl.4.dylib (compatibility version 9.0.0, current version 9.0.0)
    /opt/local/lib/libssl.1.0.0.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1.0.0)
    /opt/local/lib/libcrypto.1.0.0.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1.0.0)
    /opt/local/lib/libz.1.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1.2.8)
    /usr/lib/libSystem.B.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1238.0.0)
于 2017-01-06T18:47:46.730 回答
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这是我在我的情况下解决它的方法:

      `conda remove bcftools` 
      `conda update curl`
      `conda install bcftools`
于 2019-01-10T17:14:29.870 回答