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这是非常大数据的一小部分

df<- structure(list(A = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0, 0.68906, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.13597, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0), B = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0.40001, 0, 0, 0, 0, 0.69718, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 
0, 0.090752, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0), C = c(0, 0, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.84068, 0, 0, 0, 0.34713, 0, 0, 0, 0, 0.65201, 
0, 0, 0.25725, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0
), D = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.86419, 0, 0, 0, 0.3845, 
0, 0, 0, 0, 0.67091, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0), E = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.1083, 0.8324, 
0, 0, 0, 0.38499, 0, 0, 0, 0, 0.69064, 0, 0, 0.14596, 0, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0), F = c(0, 0, 0, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 1.0954, 0.74426, 0, 0, 0, 0.37715, 0, 0, 0, 0, 0.68884, 
0, 0, 0.20826, 0, 0.38782, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 
0, 0), G = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.0985, 0.66651, 0, 0, 
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.68861, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.1812, 
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0)), .Names = c("A", "B", "C", "D", "E", 
"F", "G"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -39L))

我想要的是当数据中有很多零时以更有压力的方式显示值

我如何绘制它是这样的

eucl_dist=dist(df,method = 'euclidean')
hie_clust=hclust(eucl_dist,method = 'complete')
my_palette <- colorRampPalette(c( "green", "yellow", "red"))(n = 1000)
heatmap.2(mydata, scale = c("none"), Colv=F, Rowv=as.dendrogram(hie_clust), 
          xlab = "X", ylab = "Y", key=TRUE, keysize=1.1, trace="none", 
          density.info=c("none"), margins=c(4, 4), col=my_palette, dendrogram="row")

但正如你所看到的,在这个小例子中,零主宰了我的情节,当它非常大时,什么都看不到。我也不能改变值的位置

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你在这里问了很多问题,我会尽力回答我看到的。

零主宰情节

零主宰你的数据,但是,零是什么意思?如果没有深入了解零的实际含义,就很难规定一种最佳的处理方法。

颜色图

您选择的彩色图并不是描述定量数据的最佳方式。我建议使用简单的白色到蓝色(或您选择的颜色),以便您的零显示为白色,并在强调非零数据的情况下隐藏。示例(仅更改my_palette <- colorRampPalette(c("white", "cornflowerblue"))(n = 1000)):

例子

更改值的位置

我不确定你在这里的意思,但布局是由你定义的树状图固定的。

于 2016-12-17T19:29:27.123 回答