python - bioconda：没有这样的文件或目录仔细构建

Question

我正在尝试verifybamid为 bioconda 构建一个新包 ()。我在一个最小的 Linux VM 上运行它，并设置了 docker、conda、bioconda-utils 等。conda build verifybamid作品。当我一开始尝试./simulate-travis.py --packages verifybamid --loglevel=debug一切正常时，但最终我得到了No such file or directory: mulled-buildtest_package() 的调用。根据bioconda-utils：

由于 mulled-build 和 involucro，现在每个构建的包都可以在一个隔离的 busybox 容器中进行测试。这将捕获配方未能在运行依赖项中指定库（例如，libgcc）的问题。

但是我必须安装哪个软件包才能使它工作？

谢谢， 安德烈亚斯

Answer 1

你需要安装galaxy-lib。实际上，它应该与您的 requiremets.txt 文件一起作为 bioconda-utils 的依赖项。如果没有，请做一个conda install galaxy-lib，你会得到 mulled-build 从 Conda 包中创建非常高效的 Docker 容器。

干杯，比约恩