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我有facet_wrap制作多个图表的功能(n=~51),但它们都出现在一页上。现在经过搜索,我发现ggplot2不能在多个页面上放置图形。

有没有办法做到这一点?我查看了这个问题(Multiple graphs over multiple pages using ggplot)并尝试了代码,但收效甚微。

这是我的图表代码,它在一页上生成约 51 个图表,使它们非常小且难以看到,如果我可以在 pdf 中将其打印为每页 1 个图表,那就太好了:

ggplot(indbill, aes(x = prey, y = weight), tab) +
geom_polygon(aes(group = load, color = capture), fill = NA, size = 0.75) +
facet_wrap(~ individual) +
theme(axis.ticks.x = element_blank(),
    axis.text.x = element_text(size=rel(0.5)),
    axis.ticks.y = element_blank(),
    axis.text.y = element_blank()) +
xlab("") + ylab("") +
guides(color = guide_legend(ncol=2)) +
coord_radar()

如果有人可以编写一些代码并向我解释,那就太好了。

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3 回答 3

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有多种方法可以进行分页:ggforcegridExtra::marrangeGrob。另请参阅此答案以获取另一个示例。

格力:

library(ggplot2)
# install.packages("ggforce")
library(ggforce)

# Standard facetting: too many small plots
ggplot(diamonds) +
  geom_point(aes(carat, price), alpha = 0.1) +
  facet_wrap(~cut:clarity, ncol = 3)

# Pagination: page 1
ggplot(diamonds) +
  geom_point(aes(carat, price), alpha = 0.1) +
  facet_wrap_paginate(~cut:clarity, ncol = 3, nrow = 3, page = 1)

# Pagination: page 2
ggplot(diamonds) +
  geom_point(aes(carat, price), alpha = 0.1) +
  facet_wrap_paginate(~cut:clarity, ncol = 3, nrow = 3, page = 2)

# Works with grid as well
ggplot(diamonds) +
  geom_point(aes(carat, price), alpha = 0.1) +
  facet_grid_paginate(color~cut:clarity, ncol = 3, nrow = 3, page = 4)

网格额外:

# install.packages("gridExtra")
library(gridExtra)

set.seed(123)
pl <- lapply(1:11, function(.x) 
  qplot(1:10, rnorm(10), main=paste("plot", .x)))

ml <- marrangeGrob(pl, nrow=2, ncol=2)

## non-interactive use, multipage pdf
## ggsave("multipage.pdf", ml)
## interactive use; calling `dev.new` multiple times
ml

reprex 包(v0.2.0.9000)于 2018 年 8 月 9 日创建。

于 2018-08-09T16:59:44.260 回答
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individual一种选择是使用您现在使用的相同代码一次绘制六个级别。您只需要对其数据的每个子集进行多次迭代。Baseball您还没有提供示例数据,所以这里有一个使用数据框的示例:

library(ggplot2)
library(vcd) # For the Baseball data
data(Baseball)

pdf("baseball.pdf", 7, 5)
for (i in seq(1, length(unique(Baseball$team87)), 6)) {
   print(ggplot(Baseball[Baseball$team87 %in% levels(Baseball$team87)[i:(i+5)], ], 
                  aes(hits86, sal87)) + 
    geom_point() +
    facet_wrap(~ team87) +
    scale_y_continuous(limits=c(0, max(Baseball$sal87, na.rm=TRUE))) +
    scale_x_continuous(limits=c(0, max(Baseball$hits86))) +
    theme_bw())
}
dev.off()

上面的代码将生成一个包含四页图的 PDF 文件,每页有六个方面。您还可以创建四个单独的 PDF 文件,每组一个六个面:

for (i in seq(1, length(unique(Baseball$team87)), 6)) {
pdf(paste0("baseball_",i,".pdf"), 7, 5)
  ...ggplot code...
dev.off()
}

如果您需要更大的灵活性,另一种选择是为分面变量的每个级别(即每个唯一值)创建一个单独的图,并将所有单独的图保存在一个列表中。然后,您可以在每一页上布置任意数量的图。这在这里可能有点矫枉过正,但这是一个灵活性派上用场的例子。

首先,让我们创建所有的图。我们将team87用作分面列。所以我们想为每个级别制作一个图team87。我们将通过拆分数据team87并为每个数据子集制作单独的图来做到这一点。

在下面的代码中,split将数据拆分为每个级别的单独数据帧team87。包装器按顺序将lapply每个数据子集馈送到 ggplot 中,为每个团队创建一个图。我们将输出保存在plist(在本例中)24 个图的列表中。

plist = lapply(split(Baseball, Baseball$team87), function(d) {
  ggplot(d, aes(hits86, sal87)) + 
    geom_point() +
    facet_wrap(~ team87) +
    scale_y_continuous(limits=c(0, max(Baseball$sal87, na.rm=TRUE))) +
    scale_x_continuous(limits=c(0, max(Baseball$hits86))) +
    theme_bw() +
    theme(plot.margin=unit(rep(0.4,4),"lines"),
          axis.title=element_blank())
})

现在我们将在一个 PDF 文件中一次布置六个图。以下是两个选项,一个包含四个单独的 PDF 文件,每个包含六个绘图,另一个包含一个四页的 PDF 文件。我还粘贴了底部的其中一个图。我们grid.arrange用来布置绘图,包括使用leftbottom参数来添加轴标题。

library(gridExtra)

# Four separate single-page PDF files, each with six plots
for (i in seq(1, length(plist), 6)) {
  pdf(paste0("baseball_",i,".pdf"), 7, 5)
  grid.arrange(grobs=plist[i:(i+5)], 
               ncol=3, left="Salary 1987", bottom="Hits 1986")
  dev.off()
}

# Four pages of plots in one PDF file
pdf("baseball.pdf", 7, 5)
for (i in seq(1, length(plist), 6)) {
  grid.arrange(grobs=plist[i:(i+5)], 
               ncol=3, left="Salary 1987", bottom="Hits 1986")
}
dev.off()
于 2016-09-28T05:44:02.883 回答
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就像是 :

by(indbill, indbill$individual, function (x){
    ggplot(x, aes(x = prey, y = weight), tab) +
    geom_polygon(aes(group = load, color = capture), fill = NA, size = 0.75) +
    theme(axis.ticks.x = element_blank(),
        axis.text.x = element_text(size=rel(0.5)),
        axis.ticks.y = element_blank(),
        axis.text.y = element_blank()) +
    xlab("") + ylab("") +
    guides(color = guide_legend(ncol=2)) +
    coord_radar()
}
于 2016-09-28T01:35:13.110 回答