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我想从一个灰度图像中的 ImageJ 中的粒子分析中绘制一个 ppp 对象，该图像的大小为 imageSizeX、imageSizeY 的点对象 Particles$X、Particles$Y 在翻转的 Java 坐标中（y0 = 左上角）。我有一种可行的解决方案（自定义示例）：

library(spatstat)

X <- ppp(Particles$X, Particles$Y, c(0, imageSizeX), c(0, imageSizeY))
plot(x = 0, y = 0, xlim = c(0, imageSizeX), ylim = c(imageSizeY, 0), type = "n", main = "Density", 
    asp = 1, axes = F, xlab = "X", ylab = "Y")
plot(density(X), xlim = c(1, imageSizeX), ylim = c(imageSizeY, 0), add = T)
plot(X, axes = TRUE, xlim = c(1, imageSizeX), ylim = c(imageSizeY, 0), add = T)
axis(1)
axis(2, las = 2)

这导致以下情节（省略了图例）：

在此处输入图像描述

但是我需要创建一个带有翻转坐标的空绘图命令（ylim = c(imageSizeY, 0)），然后必须添加 spatstat 图。

如果我尝试绘制：

library(spatstat)
X <- ppp(Particles$X, Particles$Y, c(0, imageSizeX), c(0, imageSizeY))
plot(density(X), xlim = c(1, imageSizeX), ylim = c(imageSizeY, 0))
plot(X, axes = TRUE, xlim = c(1, imageSizeX), ylim = c(imageSizeY, 0), add = T)
axis(1)
axis(2, las = 2)

坐标未翻转（ylim = c（imageSizeY，0））：

在此处输入图像描述

有没有办法在没有第一个定义绘图命令的情况下翻转 spatstat 中的绘图坐标？

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1 回答 1

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这是plot.ppp. 我已在 GitHub 上的 spatstat 存储库中的当前开发版本中修复了spatstat它1.46-1.010

spatstat在CRAN ( )的当前版本中1.46-1，windows 的 plot 方法确实可以按照您的意愿进行plot.owin识别，而不能。所以如果 X 是一个点模式，你可以做xlim, ylimplot.ppp

W <- Window(X)
plot(W, xlim=rev(W$xrange), main="The title")
plot(X, add=TRUE, ...)
于 2016-07-16T05:54:03.937 回答