beaker-notebook - 将新的 R 包添加到托管的 Beaker Lab 笔记本

Question

我想使用未包含在 Beaker 托管版本 Beaker Lab 的默认安装中的 R 包。编码：

install.packages("raster")

失败并显示以下消息：

Error
Installing package into '/usr/local/lib/R/site-library'

有没有办法在 Beaker Lab 中安装新库？

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要安装 R 包：

1）打开scratch space，点击BROWSE，创建目录rpackages

2）创建一个空白的R笔记本

3) 类型：

install.packages(‘packagename’, ‘/mnt/scratch/rpackages’, repos=’http://cran.us.r-project.org’)

并运行单元格

4）等待安装完成

5）如果安装挂起一段时间，这意味着出现故障 -> 重新加载浏览器，关闭笔记本，重新打开笔记本并重做安装命令。这将从阻塞之前的位置继续。

要使用已安装的软件包：

在您的 R 笔记本中，在第一个单元格（或使用包之前的单元格）中键入：

.libPaths(c(‘/mnt/scratch/rpackages’,.libPaths()))

并运行单元格

这是烧杯实验室的一个例子

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