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我正在尝试Rcpp使用使用外部库的代码构建一个 R 包。我之前曾在此处询问过如何在包中使用外部 C 库。我面临的问题是,只要我包含以下代码行

y = N_VNew_Serial(3);

我收到错误

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

我没有收到该行的错误

N_Vector y = NULL;

所以,我认为与图书馆的连接工作正常。我还确认了函数声明N_VNewSerial()nvector/nvector_serial.h如果你需要查看整个包代码,可以在这里

特定Rcpp文件的代码粘贴在下面

#include <Rcpp.h>

// #include <iostream.h>
#include <cvode/cvode.h>               /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include <nvector/nvector_serial.h>    /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include <cvode/cvode_dense.h>         /* prototype for CVDense */
#include <sundials/sundials_dense.h>   /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */
#include <sundials/sundials_types.h>   /* definition of type realtype */

using namespace Rcpp;

void InitialConditions (NumericVector x){

  N_Vector y = NULL;
  // y = N_VNew_Serial(3);
  //
  // NV_Ith_S(y,0) = 1;
  // NV_Ith_S(y,1) = 2;
  // NV_Ith_S(y,2) = 3;


}

我不确定为什么代码报告undefined reference给同一个头文件中的一个函数而不是另一个函数,并且非常感谢理解解决此错误的任何帮助。

谢谢!

SN248

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那是链接错误,而不是编译错误。编译成功让您进入链接步骤。但

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): \
  undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

非常清楚:R 无法构建共享库,因为您没有链接到提供它的目标代码(我想来自日晷)。

于 2016-06-14T19:48:13.503 回答