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我正在biom为 FreeBSD 打包（2.1.5）。

根据文档，我最初依赖于pynumpyand h5py，但挖掘我认为它还应该依赖于：

py27-click-6.6
py27-future-0.14.3
py27-pyqi-0.2.0
py27-scipy-0.16.1.

biom现在我正处于运行给出以下错误的地步。你有调试的建议吗？我不是python开发人员，所以请温柔。

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/biom", line 9, in <module>
    load_entry_point('biom-format==2.1.5', 'console_scripts', 'biom')()
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 547, in load_entry_point
    return get_distribution(dist).load_entry_point(group, name)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2720, in load_entry_point
    return ep.load()
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2380, in load
    return self.resolve()
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2386, in resolve
    module = __import__(self.module_name, fromlist=['__name__'], level=0)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/biom/__init__.py", line 51, in <module>
    from .table import Table
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/biom/table.py", line 188, in <module>
    from future.utils import string_types
ImportError: cannot import name string_types
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在未来的 0.14.3 中，没有string_types. future.utils（虽然它在文档中提到）。查看 github repo 的0.14.x分支以获取 future。

在撰写本文时，未来模块的当前版本是 0.15.2。因此，需要在 biom 工作之前更新该端口。我建议联系该端口的维护者。

于 2016-05-26T05:48:37.857 回答