我正在使用perlbrew
并且我想安装最新的 bioperl 版本。我应该使用cpanm
orgit
吗?
如果git
- 我只是像往常一样安装(AKAgit clone ...
然后制作和构建),还是我应该做一些特别的事情?
更新
具体来说,我不确定我是否了解BioPerl Using Git 手册中的以下专家:
告诉 perl 在哪里可以找到 BioPerl(假设您检查了 $HOME/src 中的代码;在 .bash_profile、.profile 或 .cshrc 中设置它):
bash: $ export PERL5LIB="$HOME/src/bioperl-live:$PERL5LIB" tcsh: $ setenv PERL5LIB "$HOME/src/bioperl-live:$PERL5LIB"
为什么这是必要的?
更新 2
简单地导出 bioperl 克隆目录不会影响所有bp_***.pl
脚本(通常在/usr/bin/
正常Build
安装后找到)。
在使用 切换到正确的 perl 版本后,我还尝试从克隆的目录构建perlbrerw
,但随后它运行 cpan shell 来安装一些似乎不能很好地使用的依赖项perlbrew
(而不是cpanm
)。
所以,我的问题仍然...
谢谢!