r - 从 pROC 包计算 AUC 值的 R 错误

Question

我正在尝试使用pROCR 中的包来计算灵敏度、特异性和阈值水平。这是一个示例数据

library(pROC)
x<-sample(0:1,7974,replace=T)
y<-sample(0:16049.2,7974,replace=T)
myroc<-roc(x,y)
coords(myroc, "best", ret=c("threshold", "sensitivity", "specificity"))

Error in UseMethod("coords") : 
 no applicable method for 'coords' applied to an object of class "c('double', 'numeric')"

谁能告诉我为什么会发生此错误以及如何解决？

谢谢

Answer 1

这是我最好的猜测：roc函数名称在多个包中使用（根据 sos 包pROC，目前在 CRAN 上有 11 个），如果它们稍后在您的会话中加载，这些将优先于它们。通过重新启动 R，您从搜索路径中清除了该功能并重新使用 pROC 的roc.

为确保您使用的是 pROC 的roc函数，请使用以下语法：

myroc<-pROC::roc(x,y)