r - 在树状图的节点上标注距离

Question

考虑一个简单的树状图

dend <- 1:5 %>% dist %>% hclust %>% as.dendrogram

如何注释节点上的距离（高度）？我查看了该dendextend软件包，但它没有提供这样的功能。但是，我知道我可以列出这些距离

heights <- as.list(dend %>% get_nodes_attr("height"))

非常感谢任何帮助。

Answer 1

hc2axes这是一个使用包中的简单示例pvclust：

# install.packages("pvclust") # install package if needed
plot(hc <- hclust(dist( mtcars[1:10, ])))
with(pvclust:::hc2axes(hc), 
     text(x.axis, y.axis, round(y.axis, 2), adj = c(.5, 1))
)

Answer 2

在评论的帮助下，一种解决方案是：

heights <- get_nodes_attr(HC[[i]], "height")
heights <- as.list(sort(heights))
heights[which(heights ==0)] <- NULL
for (node in 1: length(heights)){
  with(pvclust:::hc2axes(as.hclust(dend)),
    text(x.axis[node], y.axis[node], pos = 1, sprintf("%.2f", heights[node]))) 
}