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我有一个正在dcast使用reshape2包的数据框，我想删除第一列并将其改为数据框的行名。

原始数据帧，之前dcast：

> corner(df)

ID_full      gene cpm
1  S36-A1   DDX11L1   0
2  S36-A1    WASH7P   0
3  S36-A1 MIR1302-2   0
4  S36-A1   FAM138A   0
5  S36-A1     OR4F5   0

pivotdcast 表的函数：

 library(reshape2)

 pivot <- function(x){
             castTable <- x %>% dcast(ID_full ~ gene, value.var="cpm")
             }

之后dcast，包裹在我的pivot函数中：

> corner(df)

ID_full 1060P11.3 A1BG A1BG-AS1 A1CF
1  S36-A1         0    0        0    0
2 S36-A10         0    0        0    0
3 S36-A11         0    0        0    0
4 S36-A12         0    0        0    0
5  S36-A2         0    0        0    0

我希望 ID_full 成为行名，并停止作为列存在，在dcasting. 我可以在几行中执行此操作，每次都替换数据框，但我想使用运算符完成所有%>%操作。

我能想到的最好的尝试会涉及到这样的事情，但显然它不起作用：

library(dplyr)

df <- df %>% pivot(.) %>% with(., row.names=df[,1])

我会很感激任何建议......这种滋扰让我发疯！

更新：

感谢您的回答：

这个表达式很好用：

df <- df %>% pivot(.) %>% `rownames<-`(.[,1]) %>% select(-ID_full)

> corner(df)

        1060P11.3 A1BG A1BG-AS1 A1CF        A2M
S36-A1          0    0        0    0    0.00000
S36-A10         0    0        0    0    0.00000
S36-A11         0    0        0    0    0.00000
S36-A12         0    0        0    0    1.62189
S36-A2          0    0        0    0 1170.95000
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3 回答 3

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这会吗？

iris %>% `rownames<-`(seq_len(nrow(iris)))
于 2016-02-20T02:01:53.830 回答
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使用更高版本的tibble，存在更优雅的解决方案：

df <- df %>% pivot(.) %>% tibble::column_to_rownames('ID_full')

重要的是，当要转换为行名的列作为变量传递时，它也可以工作，这在函数内部非常方便！

于 2018-03-19T12:43:41.973 回答
18

您可以使用magrittr别名set_rownames：

df %>% set_rownames(.$ID_full)
于 2019-06-15T19:15:25.193 回答