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我是python中的菜鸟；我有化学背景，我正在攻读计算化学硕士学位。我正在努力尽可能快地学习计算机科学。我目前不知道如何解决这个错误。我已经用谷歌搜索了这个问题，但答案实际上并不令人满意。如果你们给我有关如何解决此错误的提示，我将不胜感激。谢谢， 清乐

为了使程序正常工作，它使用此文件中的代码，其中包含：

从 RunRMSD 导入 RunRMSD RunRMSD()

从 SumRMSD 导入 SumRMSD SumRMSD()

然后它使用文件（RunRMSD）中的代码，其中包含：

运行 calcRMSD.py 从 pymol 获取原始输出

定义运行RMSD（）：

# get output directory from a threefiles.txt
with open('./threefiles.txt') as fi:
    fline = fi.readline()
    flist = fline.split('\t')
    path_output = flist[1]

import os
command = '/opt/local/bin/pymol -cqr '+'./CalcRMSD.py > '/Users/thanhle/Desktop/output/'RMSD.out'
os.system(command)

不确定我的路径是否正确。

thanhs-MacBook-Pro-2:untitled folder thanhle$ python Director_RMSD.py
Traceback (most recent call last):
  File "Director_RMSD.py", line 5, in <module>
    RunRMSD()
  File "/Users/thanhle/Desktop/ftdock-2-dev2/untitled folder/RunRMSD.py", line 11, in RunRMSD
    command = '/opt/local/bin/pymol -cqr '+'./CalcRMSD.py > '/Users/thanhle/Desktop/output/'RMSD.out'
NameError: global name 'Users' is not defined
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1 回答 1

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“命令”变量写得不好：

command = '/opt/local/bin/pymol -cqr '+'./CalcRMSD.py > '/Users/thanhle/Desktop/output/'RMSD.out'

抛出错误是因为路径/Users/thanhle/Desktop/output/未连接，而且您缺少撇号。如果您不想将任何变量解析为命令，则应编写：

command = '/opt/local/bin/pymol -cqr ./CalcRMSD.py > /Users/thanhle/Desktop/output/RMSD.out'
于 2015-12-31T21:48:59.113 回答