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我正在尝试遍历数据集并为每个因素创建一个直方图和汇总表,并将输出保存为.svg. 使用 创建直方图,使用 创建ggplot2汇总表summary()

我已成功使用下面的代码将输出保存到单个.pdf页面,每个页面都包含相关的直方图/表格。但是,当我尝试将每个直方图/表格组合保存到一组.svg图像中时,ggsave仅使用ggplot直方图显示在.svg. 该表只是空白区域。

我尝试过使用dev.copy Cairosvg但最终都得到相同的结果:直方图呈现,但表格没有。如果我将图像保存为.png表格显示。

我将iris数据用作可重现的数据集。我没有使用R-Studio我看到的给其他人造成一些“空情节”的悲伤。

#packages used
library(ggplot2)
library(gridExtra)
library(gtable)
library(Cairo)
#Create iris histogram plot
  iris.hp<-ggplot(data=iris, aes(x=Sepal.Length)) +
    geom_histogram(binwidth =.25,origin=-0.125,
      right = TRUE,col="white", fill="steelblue4",alpha=1) + 
       labs(title = "Iris Sepal Length")+
        labs(x="Sepal Length", y="Count")
   iris.list<-by(data = iris, INDICES = iris$Species, simplify = TRUE,FUN = function(x) 
     {iris.hp %+% x + ggtitle(unique(x$Species))})

#Generate list of data to create summary statistics table
  sum.str<-aggregate(Sepal.Length~Species,iris,summary)
  spec<-sum.str[,1]
  spec.stats<-sum.str[,2]
  sum.data<-data.frame(spec,spec.stats)
  sum.table<-tableGrob(sum.data)
  colnames(sum.data) <-c("species","sep.len.min","sep.len.1stQ","sep.len.med",
  "sep.len.mean","sep.    len.3rdQ","sep.len.max")
  table.list<-by(data = sum.data, INDICES = sum.data$"species", simplify =   TRUE, 
     FUN = function(x) {tableGrob(x)})

#Combined histogram and summary table across multiple plots
 multi.plots<-marrangeGrob(grobs=(c(rbind(iris.list,table.list))),
   nrow=2, ncol=1, top = quote(paste(iris$labels$Species,'\nPage', g, 'of',pages)))

#bypass the class check per @baptiste
ggsave <- ggplot2::ggsave; body(ggsave) <- body(ggplot2::ggsave)[-2]
#
for(i in 1:3){
  multi.plots<-marrangeGrob(grobs=(c(rbind(iris.list[i],table.list[i]))),
    nrow=2, ncol=1,heights=c(1.65,.35),
    top = quote(paste(iris$labels$Species,'\nPage', g, 'of',pages)))
  prefix<-unique(iris$Species)
  prefix<-prefix[i]
  filename<-paste(prefix,".svg",sep="")
  ggsave(filename,multi.plots)
  #dev.off()
}

编辑@rawr 引用的已删除主题 tt3。它不小心留在了示例代码中。它没有引起问题,以防万一有人好奇。

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1 回答 1

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编辑: 删除之前关于它在 32 位安装而不是 x64 安装下工作的答案,因为那不是问题。仍然不确定是什么导致了这个问题,但它现在正在工作。留下关于grid.export它的信息可能对其他人来说是一个有用的选择。

下面是保存.svg'susing的循环grid.export(),尽管我遇到了一些文本格式问题(不同的数据集)。

for(i in 1:3){
 multi.plots<-marrangeGrob(grobs=(c(rbind(iris.list[i],table.list[i]))),
    nrow=2, ncol=1,heights=c(1.65,.35), top =quote(paste(iris$labels$Species,'\nPage', g, 
    'of',pages)))
prefix<-unique(iris$Species)
prefix<-prefix[i]
filename<-paste(prefix,".svg",sep="")
grid.draw(multi.plots)
grid.export(filename)
grid.newpage()
}

编辑:至于根据@baptiste 的评论使用arrangeGrob。以下是更新后的代码。我错误地使用了[]返回by列表的单括号,所以我切换到正确的双括号[[]]并习惯grid.drawggsave通话。

for(i in 1:3){
prefix<-unique(iris$Species)
prefix<-prefix[i]
multi.plots<-grid.arrange(arrangeGrob(iris.list[[i]],table.list[[i]],
   nrow=2,ncol=1,top = quote(paste(iris$labels$Species))))
filename<-paste(prefix,".svg",sep="")
ggsave(filename,grid.draw(multi.plots))
}
于 2015-12-22T19:26:40.757 回答