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我必须绘制大脑区域的连接网络。我想获得类似于图 1的东西。

图1

我能够将点放在 3D 空间中，并通过使用 python 和 mayavi 将它们与边缘链接。代码在这里：

import mayavi    

# get data
xyz = getCoords(file_coords)
communities = getCommunities(file_communities)    

mlab.figure(1, bgcolor=(0, 0, 0))
mlab.clf()

# plot points
pts = mlab.points3d(xyz[:,0], xyz[:,1], xyz[:,2],
                    communities,
                    colormap= "Blues",
                    scale_factor=7,
                    resolution=50)

# plot edges            
pts.mlab_source.dataset.lines = np.array(list_of_edges)
tube = mlab.pipeline.tube(pts, tube_radius=0.1)
mlab.pipeline.surface(tube, color=(0.5, 0.5, 0.5))

mlab.show()

您可以在此处查看代码的输出，如图 2 所示：

（不要考虑顶部的箭头和曲线，因为它们只是尝试创建一种方向） 图 2

如何创建 3D 大脑渲染以获得类似于图 1的内容：

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