python - 如何使用 python 中的 cmd 模块从 pdb 文件中打印信息？

Question

我想从几个 pdb 文件中提取信息，使用 cmd python 模块以集成 pymol 来提取信息。更具体地说，我想在 pdb 文件中找到所有金属。

使用 cmd 命令执行此任务非常简单，因为您可以键入 cmd.select ("m", "metals")。但是，这不会打印找到的金属的最终数量。

在互联网上环顾四周，我找到了 Iterate 命令，但我不知道如何使用它。（http://www.pymolwiki.org/index.php/Iterate）。

下面是我的非工作代码。

import sys
sys.path.append("C:/Python27/Lib/")

import __main__
__main__.pymol_argv = [ 'pymol', '-qc']

import pymol
from pymol import cmd

import glob
a = glob.glob("C:/Python27/Metal/*.pdb")

for file in a:
    f= open (file, 'r')
    cmd.iterate ("m","metals")
    print ?

pymol.finish_launching()
pymol.cmd.quit()