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这是有罪的代码(它与我问的另一个问题有关,这里):

program foo

  use mpi

  implicit none

  type double_st
     sequence
     real(kind(0.d0)) :: x,y,z
     integer :: acc
  end type double_st

  integer, parameter :: n=8

  INTEGER :: MPI_CADNA_DST

  integer :: nproc, iprank
  INTEGER :: IERR, STAT(MPI_STATUS_SIZE)
  INTEGER :: MPI_CADNA_DST_TMP
  INTEGER ::&
       COUNT=4,&
       BLOCKLENGTHS(4)=(/1,1,1,1/),&
       TYPES(4)=(/MPI_DOUBLE_PRECISION,&
       MPI_DOUBLE_PRECISION,&
       MPI_DOUBLE_PRECISION,&
       MPI_INTEGER/)
  INTEGER(KIND=MPI_ADDRESS_KIND) :: DISPLS(4), LB, EXTENT
  TYPE(DOUBLE_ST) :: DST
  INTEGER :: I

  type(double_st), allocatable :: bufs(:), bufr(:)

  allocate(bufs(n), bufr(n))

  CALL MPI_INIT(IERR)
  CALL MPI_COMM_SIZE(MPI_COMM_WORLD, NPROC, IERR)
  CALL MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD, IPRANK, IERR)

  CALL MPI_GET_ADDRESS(DST%X,   DISPLS(1))
  CALL MPI_GET_ADDRESS(DST%Y,   DISPLS(2))
  CALL MPI_GET_ADDRESS(DST%Z,   DISPLS(3))
  CALL MPI_GET_ADDRESS(DST%ACC, DISPLS(4))
  DO I=4,1,-1
     DISPLS(I)=DISPLS(I)-DISPLS(1)
  ENDDO
  CALL MPI_TYPE_CREATE_STRUCT(4,BLOCKLENGTHS,DISPLS,TYPES, MPI_CADNA_DST_TMP,IERR)
  CALL MPI_TYPE_COMMIT(MPI_CADNA_DST_TMP,IERR)

  CALL MPI_TYPE_GET_EXTENT(MPI_CADNA_DST_TMP, LB, EXTENT, IERR)
  CALL MPI_TYPE_CREATE_RESIZED(MPI_CADNA_DST_TMP, LB, EXTENT, MPI_CADNA_DST, IERR)
  CALL MPI_TYPE_COMMIT(MPI_CADNA_DST,IERR)

  bufs(:)%x=iprank
  bufs(:)%y=iprank
  bufs(:)%z=iprank
  bufs(:)%acc=iprank
  call mpi_send(bufs(1), n, mpi_cadna_dst, 1-iprank, 0, mpi_comm_world, ierr)
  call mpi_recv(bufr(1), n, mpi_cadna_dst, 1-iprank, 0, mpi_comm_world, stat, ierr)


  deallocate(bufs, bufr)

end program foo

使用 intelMPI 版本 4.0 或 5.0 编译时,我在发送时使用 valgrind 或 dmalloc 收到无效的读/写错误。使用openMPI,这个最小示例还不是很清楚,但是我在从中提取它的大代码中遇到了类似的通信问题。

感谢您的帮助!

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2 回答 2

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看起来使用sequence是这里的罪魁祸首。由于您的数据未以相同的方式对齐,因此使用sequence关键字强制线性打包会生成一些未对齐的访问,可能是在写入其中一个数组时。删除它就可以了。

于 2015-09-02T10:20:31.440 回答
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我认为他使用了带有序列的派生类型定义(编写代码的人)。SEQUENCE 导致派生类型的组件以它们在类型定义中列出的相同顺序存储。如果指定了 SEQUENCE,则组件定义中指定的所有派生类型都必须是序列类型。你应该告诉我们更多关于编译的信息,你是在 Linux 上还是在 Windows 上。

于 2015-09-02T11:46:17.767 回答