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我有一个fits图像,我试图在我的图像中找到局部最大值的坐标,但到目前为止我还不能让它工作。我的图片可以在这里找到。到目前为止我所拥有的是

import numpy as np
import scipy.nimage as ndimage
from astropy.wcs import WCS
from astropy import units as u
from astropy import coordinates as coord
from astropy.io import fits
import scipy.ndimage.filters as filters
from scipy.ndimage.filters import maximum_filter
hdulist=fits.open("MapSNR.fits")
#reading a two dimensional array from fits file
d=hdulist[0].data
w=WCS("MapSNR.fits") 
idx,idy=np.where(d==np.max(d))
rr,dd=w.all_pix2word(idx,idy,o)
c=coord.SkyCoord(ra=rr*u.degree, dec=dd*u.degree)
#The sky coordinate of the image maximum
print c.ra
print c.dec

这就是我如何找到图像的全局最大值,但我想获得具有大于 3 意义的局部最大值的坐标。

我通过在网上查找发现以下答案在我的情况下无法正常工作。 更新:我用过这个功能

def detect_peaks(data, threshold=1.5, neighborhood_size=5):

  data_max = filters.maximum_filter(data, neighborhood_size)
  maxima = (data == data_max)
  data_min = filters.minimum_filter(data, neighborhood_size)
  diff = ((data_max - data_min) > threshold)
  maxima[diff == 0] = 0 # sets values <= threshold as background
  labeled, num_objects = ndimage.label(maxima)
  slices = ndimage.find_objects(labeled)
  x,y=[],[]
  for dy,dx in slices:
    x_center = (dx.start + dx.stop - 1)/2
    y_center = (dy.start + dy.stop - 1)/2
    x.append(x_center)
    y.append(y_center)
  return x,y

我想找到一种使用更好方法的方法,例如数组中的导数或分治法。我将寻求更好的推荐解决方案。

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所以我有了这个,使用 skimage 自适应阈值。希望能帮助到你:

原来的 在此处输入图像描述

代码

from skimage.filters import threshold_adaptive
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy import misc, ndimage
import numpy as np

im = misc.imread('\Desktop\MapSNR.jpg')

# Apply a threshold
binary_adaptive = threshold_adaptive(im, block_size=40, offset=-20).astype(np.int)
# Label regions and find center of mass
lbl = ndimage.label(binary_adaptive)
points = ndimage.measurements.center_of_mass(binary_adaptive, lbl[0], [i+1 for i in range(lbl[1])])

for i in points:
    p = [int(j) for j in i]
    binary_adaptive[i] += 5

plt.figure()
plt.imshow(im, interpolation='nearest', cmap='gray')
plt.show()

plt.figure()
plt.imshow(binary_adaptive, interpolation='nearest', cmap='gray')
plt.show()

输出

在此处输入图像描述

更改阈值的参数将对找到局部最大值的位置以及找到多少个最大值产生很大影响。

于 2015-08-16T21:06:59.597 回答
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您可以使用photutils.detection.find_peaks函数,它是photutils 检测方法之一。

如果您查看 photutils.detection.find_peaks 实现,您会发现它使用scipy.ndimage.maximum_filter来计算最大图像(默认情况下,在 3x3 框大小的足迹中)并找到原始图像等于最大值的像素图片。

该功能的其余部分主要用于您可能也感兴趣的两件事:

  1. 如果你传入一个wcs对象,你可以得到天空坐标,而不仅仅是像素坐标。
  2. 有一个选项可以获得亚像素精度坐标。
于 2015-08-17T21:03:00.107 回答