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我正在尝试注册两个大脑图像卷(每个都包括 2D 切片)。第一个体积(目标或移动体积)的切片厚度和间距分别为 1.5 和 [1.5 1.5]。对于第二个(参考体积),这些值为 4 和 [0.9375 0.9375]。切片的数量也不同。第一卷有 96 片,第二卷有 44 片。

我的一位朋友建议使体素各向同性,但我不知道该怎么做。我可以看到第一卷是各向同性的,但不是第二卷。我想知道我应该怎么做?

此外,我将考虑每个卷的两个切片,并在其上应用特征提取方法。因此,这两个切片都应该与大脑的同一层(同一场景)相关。考虑到切片的数量不同,我应该怎么做以及我应该如何重新计算第一卷的新切片与第二卷相同?

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如果我正确理解你的问题,听起来你想用给定大小的体素插入一个图像堆栈,以便你定义一个新的坐标系,其中每个体素都是各向同性的(即具有相等的高度宽度和深度,即立方体素)。如果是这样,可能会有所帮助:

(我以 matlabs 提供的 mri 数据为例)

load mri D
D=double(squeeze(D));   % remove singleton dimension, convert to double
szD_a=size(D);          % get size of original image stack
vox_a = [.4, .4, .45];  % define size of voxel in original image stack
vox_b = [.25, .25, .25];% define size of voxel in target image stack
szD_b = ceil((size(D)-1).*vox_a./vox_b)+1; % set size of target image stack

% define coordinates of voxels in original image stack
[Xa,Ya,Za]=meshgrid(...
    [0:szD_a(1)-1]*vox_a(1),...
    [0:szD_a(2)-1].*vox_a(2),...
    [0:szD_a(3)-1].*vox_a(3));

% define coordinates of voxels in original image stack
[Xb,Yb,Zb]=meshgrid(...
    [0:szD_b(1)-1]*vox_b(1),...
    [0:szD_b(2)-1].*vox_b(2),...
    [0:szD_b(3)-1].*vox_b(3));

D_target = interp3(Xa,Ya,Za,D,Xb,Yb,Zb);

figure
for t=0:vox_b(3):max(Zb(:))
    subplot(1,2,1)
    imagesc(D(:,:,floor(t/vox_a(3))+1))
    subplot(1,2,2)
    imagesc(D_target(:,:,floor(t/vox_b(3))+1))
    drawnow
    pause(0.1)
end
于 2016-01-30T03:48:12.957 回答