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我有几个具有不同几何/轮廓的裁剪栅格。具体来说,来自同一油田几年的空间产量图,但程度不同——测量结果并不总是整个油田,而在某些年份只是其中的一部分。我想计算这些地图的平均值并将它们组合成一个平均值栅格。然而,这确实意味着,并不是说 5 个图层/栅格中的每个像素都有一个值。我可以接受这些缺失值是 NA,因此最终平均值只能通过假设 3 个栅格用于地图不重叠的部分字段来计算。

我想用'extend {raster}'扩展光栅,用NA值填充非重叠部分:

y <- extend(y, shape, value=NA) #Shape 是一个矩形形状,包含所有产量地图栅格

这适用于所有栅格。但是它们仍然没有相同的程度。即使我将范围调整到矩形 shapefile 的范围setExtent()extent() <- extent()什至调整到其他扩展栅格之一,我仍然得到:

compareRaster(x) 中的错误:不同的数字或列

..当我想堆叠它们并使用calc(y, fun=mean,...). 原始栅格范围差异太大,无法重新采样。但它们确实具有相同的分辨率和 CRS。

有谁知道如何解决这个问题?

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如果您想实现诸如 之类的操作calc(y, fun=mean,...),您可以获得栅格的最小公共范围,并在将它们堆叠在一起并应用操作之前将它们全部裁剪到该范围。

假设您有三个栅格:

# Generate 3 dummy rasters with different extents
r1 <- raster( crs="+proj=utm +zone=31")
extent(r1) <- extent(0, 100, 0, 500)
res(r1) <- c(5, 5)
values(r1) <- sample(10, ncell(r1), replace=TRUE)

r2 <- raster( crs="+proj=utm +zone=31")
extent(r2) <- extent(10, 120, -10, 400) 
res(r2) <- c(5, 5)
values(r2) <- runif(ncell(r2), 1, 10)

r3 <- raster( crs="+proj=utm +zone=31")
extent(r3) <- extent(50, 150, 30, 200) 
res(r3) <- c(5, 5)
values(r3) <- runif(ncell(r3), 1, 10)

第一种方法:

# Summing your rasters will only work where they are not NA
r123 = r1+r2+r3 # r123 has the minimal common extent
r1 = crop(r1, r123) # crop to that minimal extent
r2 = crop(r2, r123)
r3 = crop(r3, r123)

s123 = stack(r1, r2, r3)
s123.mean = calc(s123, fun=mean)

另一个:

# Manually compute the minimal extent
xmin <- max(bbox(r1)[1,1], bbox(r2)[1,1], bbox(r3)[1,1])
xmax <- min(bbox(r1)[1,2], bbox(r2)[1,2], bbox(r3)[1,2])  
ymin <- max(bbox(r1)[2,1], bbox(r2)[2,1], bbox(r3)[2,1])  
ymax <- min(bbox(r1)[2,2], bbox(r2)[2,2], bbox(r3)[2,2])  
newextent=c(xmin, xmax, ymin, ymax)
r1 = crop(r1, newextent)
r2 = crop(r2, newextent)
r3 = crop(r3, newextent)

s123 = stack(r1, r2, r3)
s123.mean = calc(s123, fun=mean)

我不太确定您到底想要什么,但是如果您真的想保持所有栅格完整(无crop操作),您还可以计算最大范围(与上面的第二种方法相同,只需反转minand max)和extend所有栅格在堆叠它们之前到那个(同样的,你最终会得到更大的光栅,充满了 NA ......不确定这是否真的需要):

xmin <- min(bbox(r1)[1,1], bbox(r2)[1,1], bbox(r3)[1,1])
xmax <- max(bbox(r1)[1,2], bbox(r2)[1,2], bbox(r3)[1,2])  
ymin <- min(bbox(r1)[2,1], bbox(r2)[2,1], bbox(r3)[2,1])  
ymax <- max(bbox(r1)[2,2], bbox(r2)[2,2], bbox(r3)[2,2])  
newextent=c(xmin, xmax, ymin, ymax)
r1 = extend(r1, newextent)
r2 = extend(r2, newextent)
r3 = extend(r3, newextent)
s123 = stack(r1, r2, r3)
s123.mean = calc(s123, fun=mean)

这有帮助吗?

笔记

您可能不想玩setExtent()or extent() <- extent(),因为您可能会以错误的栅格地理坐标结束(即,范围会被修改,但内容不会被修改,因此您实际上可能会翻译您的栅格而没有将其作为结果它们之间的重叠在物理上没有意义)。

于 2015-06-29T12:33:47.373 回答
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我在存储一些栅格时遇到了同样的问题,这些栅格包含 bioclim 数据。我发现我确实裁剪正确,但是以不同的分辨率下载它们。查看每个栅格的列数。只需在 R 中输入栅格(文件)的名称即可完成。它们可能大小相同。我希望我能以某种方式提供帮助。

于 2017-03-03T02:41:06.650 回答