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我是相当新docopt的用于在 R 中传递参数。

我有这样的事情：

#!/n/tools/script
##First read in the arguments listed at the command line
library(docopt)
require(methods)

"
Usage:
  Finding.R [options] FILE

  Description:   
  Options:
   --help                        Show this screen
   --version                     Show the current version.
   --Threshold=<Threshold>       [default: 250]
   --output=OUTPUT               [default: out.txt]
   --color=<color>               [default: FALSE]
  Arguments:
   FILE  The tree file
  " -> doc

  opt <- docopt(doc)

前 2 行来自之前的代码，其余的是关于我当前的工作。

我的问题是，当我运行它时，

Finding.R --Threshold 250 INPUT

而不是警告、错误或连贯的东西，我只是在另一个窗口中得到相同的脚本，就像什么都没发生一样。我认为这是我的选择问题，但后来我尝试了：

Finding.R --help

什么也没发生。

有人可以对此有所了解吗？当然我做错了什么，但是在浏览了很多网页之后，我找不到任何有用的东西。

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1 回答 1

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这里有两个潜在的问题。首先是您可能没有调用 R；第二个是你没有对你解析的选项做任何事情。下面是一个简单的示例：请注意，我们在第一行调用 Rscript，并在最后一行打印解析的选项。

#!/usr/bin/env Rscript 

library(docopt)
"Usage:
  Finding.R [options]

Options:
--Threshold=<Threshold>       [default: 250]
--output=OUTPUT               [default: out.txt]
--color=<color>               [default: FALSE]
" -> doc

opt <- docopt(doc)
print(opts)

在命令行：

chmod +x Finding.R
./Finding.R
$`--Threshold`
[1] "250"

$`--output`
[1] "out.txt"

$`--color`
[1] "FALSE"

$Threshold
[1] "250"

$output
[1] "out.txt"

$color
[1] "FALSE"
于 2015-10-14T14:52:24.913 回答